Cơ cấu tổ chức

- Các phòng, ban chức năng gồm 4 phòng, 3 ban: Phòng Chính trị; Phòng Đào tạo; Phòng Tham mưu - Hành chính; Phòng Hậu cần - Kỹ thuật; Ban Khảo thí và Bảo đảm chất lượng đào tạo; Ban Khoa học quân sự; Ban Tài chính.
- Các khoa, gồm 9 khoa: Khoa Tên lửa; Khoa Ra đa; Khoa Pháo phòng không - Trạm nguồn; Khoa Cơ bản-Cơ sở; Khoa Khoa học xã hội và Nhân văn; Khoa Tay nghề; Khoa Thông tin-Khí tượng; Khoa Hậu cần-Kỹ thuật; Khoa Quân sự chung.
- Các đơn vị quản lý học viên gồm: tiểu đoàn 1, 2, 3 và Đại đội 14; Tiểu đoàn 4 đảm bảo kỹ thuật.